Bonjour,
J'avais du temps à perdre...

J'ai donc réinstallé Finale 25. La seule façon, chez moi, de reproduire votre problème, et donc sans la certitude que ce soit effectivement ce qui vous concerne, est de "glisser" la fenêtre d'édition des marges en dehors de l'écran. Il convient, comme dans la FAQ mentionnée, de la repositionner correctement. Si ça ne marche pas, une autre façon de résoudre cela est de réinitialiser la position des fenêtres (en effet, en désinstallant Finale, vous conservez les fichiers d'initialisation, de même que certaines clés qui sont inscrites/modifiées dans la base de registre, et ces derniers seront repris lors de votre réinstallation ; c'est utile quand on fait des mises à jour mais cela ne résout pas le problème ici) Pour ce qui concerne donc la position de votre fenêtre devenue invisible, vous pourrez la récupérer en modifiant la clé correspondante, dans la base de registre, qu'a créée Finale pour enregistrer la position de la fenêtre.
Fermez Finale.
En bas de votre écran, dans la zone "Recherche" du bureau Windows, tapez "regedit" et cliquez sur "Editeur du registre" qui apparaît. Acceptez pour le lancer.
Ensuite, développez dans la fenêtre de gauche: Ordinateur\HKEY_CURRENT\Software\MakeMusic\Finale\Dialog Location
Dans la page de droite, vous aurez EditPageMargins ; Cliquez dessus avec le bouton droit et choisissez "Supprimer"
Cliquez sur OK. Vous pouvez quitter l'éditeur de registre.
Normalement, la fenêtre qui avait disparu réapparaîtra au milieu de l'écran lorsque vous y ferez appel, et si vous avez la curiosité de revenir dans l'éditeur de registre, vous constaterez que Finale a recréé la clé supprimée, avec de nouvelles coordonnées pour la fenêtre.
En espérant que cela soit donc bien là que réside votre problème.